瓦格纳的历史始于一百多年前，即 1883 年，纽约州罗切斯特市路德会神学院成立。学校只有六名学生，住在私人住宅的二楼，开始了培养未来路德会部长的使命进入神学院。瓦格纳在成立后不久就获得了今天的名字。当约翰·G·瓦格纳（John G. Wagner）向学校捐赠 12,000 美元以购买新校区时，感激的董事会将学校重新命名，以纪念他们恩人的儿子乔治·瓦格纳（George Wagner），他在实现自己成为牧师的雄心之前就去世了。

随着学校的声望和规模不断扩大，自 1888 年以来一直控制瓦格纳的路德教会组织纽约部长会议认识到需要为该机构寻找新家，并将瓦格纳的第一批毕业生之一弗雷德里克萨特牧师安置在搬迁费用。萨特牧师是瓦格纳学院的终身支持者，他于 1907 年在史泰登岛建立了自己的事工。通过萨特的努力，瓦格纳学院于 1918 年搬迁到史泰登岛的 Grymes Hill。萨特牧师为这个新址选址再合适不过了。开始。新校区位于 19 世纪航运巨头爱德华·库纳德爵士 (Sir Edward Cunard) 占地 38 英亩的前乡村庄园内。这个令人叹为观止的地点俯瞰纽约港、曼哈顿和大西洋，是瓦格纳现代历史开始的理想地点。